بررسی کارآیی الگوریتم مورد استفاده در تجزیه کلاستر ۲۶
شاخص شانون ۲۷
بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت­ها براساس آنالیز Nei 27
سابقه تحقیق ۲۸
۱-۱۵-۱- مروری بر برخی پژوهش­های انجام شده بر روی Quercus brantii Lindl. 28
۱-۱۵-۲- مروری بر برخی پژوهش­های انجام شده با بهره گرفتن از نشانگرSRAP 28
فصل دوم: مواد و روش­ها
۲-۱- انتخاب مناطق و جمعیت­ها ۳۳
۲-۲- جمع­آوری نمونه ها و آماده سازی آنها ۳۴
۲-۳- استخراج DNA از نمونه های گیاهی ۳۴
۲-۳-۱- آماده کردن نمونه ها ۳۴
۲-۳-۲- استخراج DNA ۳۵
۲-۳-۲-۱- مواد موردنیاز ۳۵
۲-۳-۲-۲- روش کار ۳۶
۲-۴- تعیین کیفیت وکمیت DNA ۳۷
۲-۵- واکنش زنجیره ای پلیمراز) (PCR ۳۹
۲-۶- الکتروفورز ۴۱
۲-۶-۱- محلول اتیدیوم بروماید ۴۲
۲-۶-۲- تهیه ژل الکتروفورز ۴۳
۲-۶-۳- الکتروفورز محصول PCR ۴۳
۲-۷- تجزیه و تحلیل داده ها ۴۴
فصل سوم: نتایج و بحث
۳-۱پلی­مورفیسم ۴۶
۳-۲ بررسی پارامترهای اصلی تنوع ژنتیکی همه لوکوس­ها در جمعیت­های گونهQuercus brantii Lindl. ۵۰
۳-۳ بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت­ها براساس آنالیز Nei 52
۳-۴ شباهت و فاصله ژنتیکی بین ۵ جمعیت ۵۴
۳-۵ بحث و نتیجه ­گیری کلی ۵۵
۳-۶ پیشنهادات ۵۹
منابع ۶۲
فهرست شکل­ها
شکل۱- ۱ پراکندگی جهانی جنس بلوط (Quercus) 6
شکل ۱-۲ پراکندگی جنس بلوط(Quercus) در ایران ۷
شکل ۱-۳ نمایی از گونه Quercus brantii Lindl. 10

شکل ۱-۴ نحوه اتصال پرایمرهای forward و reverse به DNA الگو ۲۰

شکل ۱-۵ واکنش زنجیره­ای پلی­مراز ۲۴
شکل۲- ۱ جمعیت­ها و مناطق بررسی شده در این تحقیق ۳۳
شکل۲-۲ نمونه­های برگ تازه در آزمایشگاه ۳۴
شکل ۲-۳ دستگاه اسپکتروفتومتر برای تعیین کمیت DNA 38

شکل ۲-۴ دستگاه ترموسایکلر ۴۱
شکل ۲-۵ دستگاه الکتروفورز عمودی ۴۲
شکل ۲-۶ ساختار اتیدیوم برماید ۴۲
شکل ۲-۷ دستگاه ژل داک ۴۳
شکل ۳-۱ الگوی باندی پرایمر ۴۶
شکل ۳-۲ دندروگرام ژنوتیپ های مورد بررسی ۵۵
فهرست جداول:
جدول ۲-۱ اسامی جمعیت­ها و مناطق بررسی شده در این تحقیق ۳۳
جدول ۲-۲ مواد استفاده شده در PCR 39
جدول ۲-۳ برنامهPCR 40
جدول ۲-۴ پرایمرهای مورداستفاده در آزمایش ۴۰
جدول ۳-۱ نتایج کدگذاری آغازگر Me2-Em2 برای همه جمعیت­ها ۴۷